O seu problema é bastante simples de se resolver. Para um produto aparecer na loja, é necessário que o cadastro do mesmo obedeça a certos critérios obrigatórios. São eles:

- estar cadastrado em uma ou mais categorias (vitrine, resultado da busca ou qualquer outra categoria que tenha criado);

- que tenha estoque (pode-se exibir produtos esgotados nas categorias);

- que tenha no mínimo uma lista de preço cadastrada.

- a ferramenta de "Verificar Pendências" do cadastro de produtos serve somente para verificar pendências de itens recomendados mas não obrigatórios como, por exemplo, meta-tags, tagcloud e resenhas detalhadas. Ela não verifica se foi cadastrado uma lista de preços, mesmo porque informar o preço do produto é uma etapa obrigatório ao se cadastrar um novo produto.